| 省庁・自治体・機関名 | 代表者 | 事業・制度の名称 | 課題名 |
| 文部科学省科学研究費 | 荒木令江 | 挑戦的萌芽研究 | 融合フォスフォ/グライコ-プロテオミクスによるグリオーマ幹細胞の標的シグナル解析 |
| 文部科学省科学研究費 | 荒木令江 | 基盤研究(B) | NF1・NF2 遺伝子産物機能破綻による神経系腫瘍発生機構解明と分子治療戦略の構築 |
| 文部科学省科学研究費 | 荒木令江 | 特別研究員奨励費 | 胆管癌とその幹細胞の悪性分化に関わる新規糖鎖修飾蛋白質の同定と構造機能の解析 |
| 独) 科学技術振興機構JST | 荒木令江 | 統合化推進プログラム | プロテオーム統合データベースの構築 |
| 国立研究開発法人日本医療研究開発機構 | 荒木令江 | 戦略的国際共同研究プログラム | 東アジア共同研究プログラム メコン川流域における肝吸虫患者のQOL維持とがん予防に資する革新的診断システムの開発と普及 (分担) |
| エーザイ株式会社 | 荒木令江 | 産学連携共同研究 | プロテオミクス解析による創薬ターゲットの探索 |
| カネボウ化粧品株式会社 | 荒木令江 | 産学連携共同研究 | 表皮ＣＭＬ化蛋白質のプロテオミクス解析 |
| シャープ株式会社 | 荒木令江 | 産学連携共同研究 | 融合プロテオミクスによる細胞内シグナル解析法の開発 |
| 文部科学省科学研究費 | 荒木令江 | 挑戦的萌芽研究 | 融合プロテオミクスと組織像の統合解析による転移性口腔がん検出システムの開発 |
| 文部科学省科学研究費 | 荒木令江(分担) | 基盤研究(B) | 微小環境がもたらす肝癌の治療抵抗性の獲得機構 (代表研究者：佐々木裕) |
| 文部科学省科学研究費 | 荒木令江(分担) | 基盤研究(C) | 膜透過性ペプチドを用いた悪性神経膠腫腫瘍幹細胞に対する治療の実現化の研究(代表研究者：中村英夫) |
| 国立研究開発法人科学技術振興機構(JST) | 荒木令江 | ライフサイエンスデータベース統合推進事業「統合化推進プログラム」 | プロテオーム統合データベースの構築 |
| 国立研究開発法人日本医療研究開発機構(AMED) | 荒木令江(分担) | e-ASIA 共同研究プログラム「感染症」分野 | メコン川流域における肝吸虫患者のQOL維持とがん予防に資する革新的診断システムの開発と普及 (代表研究者：成松 久) |
| 文部科学省科学研究費 | 荒木 令江（分担） | 挑戦的萌芽研究 | 新規融合グライコプロテオミクスによるグリオーマ幹細胞の分化ニッチ制御機構の解明（代表研究者：南部 晶子） |
| 文部科学省科学研究費 | 荒木 令江（分担） | 基盤研究(C) | 大腸癌の浸潤・転移におけるCdh1の役割の解明（代表研究者：直江 秀昭） |
